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基金缺工作基础?毕业缺文章?生信分析了解一下

来源:本站原创 浏览:223次 时间:2021-05-17

今天来讲讲大家最关心的1~5分生信类的SCI文章发表情况,顺手也可以为基金申请做一个很好的工作基础的铺垫。

为什么说大家最关心1~5分的呢?因为首先,这类文章属于article,被单位所认可和接受。然后1分以下的SCI文章可以说大家都不缺少,甚至可以偏激地认为“一文不值”,而5分以上SCI呢,又太难了,好不容易有个OT(Oncotarget)可以灌灌水,CPB(Cell Physiol Biochem)也可以冲一冲,但OT已死,CPB能坚持多久,大家心中自有分寸。

“灌水一时爽,到头全白忙”,近些年科研中的这些坑我们深受其害,所以咱们要擦亮眼睛,搞清楚哪些期刊比较“危险”,时刻做好心理准备。

好了,咱们一起来看看1~5分的生信类SCI更偏向发表在哪些杂志上。

我们在Pubmed上通过关键词“bioinformatics,TCGA,Gene Expression Omnibus,Arrayexpress”,然后去掉重复后获得了共912篇此类文章。

 其中2~3分的文章也是最多的,毕竟此档次也是最实用的一个层次。

2018年的总的生信类文章还是要远远多于2017年的,增长了一倍。

那么师兄从这些文章里面总结了,每个不同分档的SCI文章需要完成的工作量也是不同的,如下:

生信文章分步走↓↓↓

1~2

2~3

3~5

找分子

生信分析找差异

qPCR验证

不必须

不必须

临床数据、预后分析

细����,����胞功能

特征蛋白、表型检测

/

不必须

动物实验

疾病模型:分子、病理数据

/

/

不必须

机制研究

机制研究:A→B→C

/

/

不必须


下面我们来看看不同档次的生信类SCI最喜欢发表的期刊(或者期刊最喜欢生信类文章吧)

(1)1~2分的生信SCI期刊

很显然这个档次的工作量不会很大,往往都不需要做任何的湿实验,没有Q-PCR实验、细胞功能实验这些,有的只是:基因的表达差异分析、蛋白互作网络分析、临床资料的回顾(生存分析等)等等,所以周期往往很短,短平快的骚操作。

仅仅今年上半年的发表量(84篇)就已经超过了去年一整年(78篇),增长速度很快,我们以前说过如果数据挖掘类的文章哪一天变成了meta文章一样烂大街,灌水也就失去了意义,各个单位也会迅速把这类文章拉黑的。

那么再来看看哪些期刊比较喜欢这类文章,容易发表呢?

排名前三的果然是大家心目中的样子:Mol Med Rep、Oncol Lett、Medicine (Baltimore)

杂志名称

数量

Mol Med Rep

125

Oncol Lett

43

Medicine (Baltimore)

12

Exp Ther Med

11

Mol Biol Rep

11

Pathol Res Pract

9

Pathol Oncol Res

7

Tumori

6

World J Surg Oncol

6

BioData Min

4

Comput Biol Chem

4

Eur J Med Res

4

Int J Clin Exp Med

4

J Comput Biol

4

其他40本杂志

65

大家尽量不要优先投前三,这三个杂志也是比较岌岌可危的情况。

①来自于希腊的Mol Med Rep,从2016年的数字来看,论文75%就来自中国大陆了,北京大学深圳医院(深圳市中心医院)一年就发表了超过66篇文章(不只是生信文章)在这上面,MMR一直坚挺到现在,也是服气的(是不是上面有人啊)。

②Oncol lett被国内很多单位评为负面期刊,甚至有些单位已经拉黑了,除此以外,一审太耗时间,要3个月以上,而且整的都是一些犄角旮旯里的不专业的审稿人,非常不专业,不赶时间的话,尽量改投其他的期刊。

③Medicine:接收量不算高,一年才10篇左右生信类文章,不过也被很多单位诟病了,慎投。

其他杂志可以瞄准了投一投。


(2)2~3分的生信SCI期刊

这个档次的文章可能是大家比较喜欢的档次了,分值马马虎虎,如果数据不足或者想着要急用的一些童鞋呢,最优先考虑的肯定是这个档次的,因为3分以上的其实是看运气的,有的时候质量可以也不一定能被认可呢,更别说赶时间了,师兄见过很多童鞋都是博士最后一年没办法了才开始做实验发文章,显然时间已经不是那么绰绰有余了。

可以看到,这个档次的文章虽然越来越多,但是增长的速度明显有一定限制的,毕竟还是需要一些真材实料的文章质量。

来看一看,排在前三的是:BMC Bioinformatics、PLoS One、Gene,其他一些杂志可以投一投,这三者不要优先投。

杂志

数量

BMC Bioinformatics

79

PLoS One

73

Gene

25

Oncol Rep

17

BMC Syst Biol

15

BMC Med Genomics

12

Biomed Res Int

11

Int J Mol Med

11

Mol Biosyst

9

PeerJ

7

Am J Transl Res

5

Cancer Biomark

5

Cancer Cell Int

5

FEBS Open Bio

5

Med Oncol

5

Arch Gynecol Obstet

4

Diagn Pathol

4

J Ovarian Res

4

Reprod Sci

4

其他48本杂志

63


(3)3~5分的生信SCI期刊

显然这个档次的文章已经不能随便灌水了,一般来讲,需要有一定程度的实验深度,生信分析之后的基因需要在组织样本、细胞中甚至是动物层面做一些验证实验,当然对分子机制的深入探讨要视前期的工作量了,通常有些童鞋为了急着毕业,把提前完成的工作或者本来可以发表到5分以上的文章改投这个档次的一些期刊,毕竟科研不能掐准时间说何时有好的结果,全凭自己对科研的理解程度以及合理安排实验的时间统筹了。

这个档次最喜欢这类文章的期刊前三包括:BMC Genomics、BMC Cancer、PLoS Comput Biol

杂志

数量

BMC Genomics

40

BMC Cancer

19

PLoS Comput Biol

18

Int J Oncol

13

Gynecol Oncol

11

Clin Epigenetics

7

Database (Oxford)

7

J Transl Med

7

Ann Surg Oncol

5

Hum Mutat

5

Int J Mol Sci

5

J Cell Biochem

5

J Proteome Res

5

Methods

5

Cancer Gene Ther

4

其他60本杂志

78

BMC GENOMICS 影响因子3.729,其中BMC的意思是BioMed Central系列期刊。

BioMed Central出版商每篇论文的版面费1-2万元,如果每种期刊每年发100篇论文,那么每年这个出版社收取的版面费数以亿计!2014年的大规模撤稿事件,有很多文章就来自于这家出版商。

商业利益的驱使必然导致一些漏洞存在,就像去年的TB事件一样,过犹不及,投稿的期刊要慎之又慎,而且自己的文章不要有造假的问题,灌水归灌水,但是造假就是学术不端了,否则后果就是毁灭性的。


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